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在日本，电话号码短信的收费方式通常由所使用的移动通信公司决定，不同的公司有不同的收费标准。一般来说，日本短信的收费标准大致如下。
1、日本的通信运营商采用按条计费的方式，每条短信的收费标准可能是几十到一百多日元不等，折合人民币大概是5元到百元不等，具体的收费标准可能会因运营商的不同而有所差异。
2、有些通信套餐会提供包含一定数量的免费短信条数，超出部分则需要额外付费。
3、如果是在日本境内发送国际短信，可能会有额外的费用，发送国际短信的资费要高于发送国内短信的资费。
收费标准可能随着市场变化和时间推移而有所不同，建议在日本需要发送短信的用户，最好直接联系自己的通信公司或查看其官方网站以获取最新的收费信息，如果有大量短信通信的需求，可以考虑购买通信套餐或使用其他通信服务以获得更经济的费用。